Le Père O'Malley, un prêtre aux méthodes non conventionnelles, vient sauver une école paroissiale de la fermeture. A ses côtés, une jeune nonne stricte et sans fantaisie, dont le caractère austère suscitera de petites escarmouches quotidiennes avec ce dernier. Mais ils sauront unir leurs forces lorsqu'un homme d'affaires sans scrupules tentera de s'emparer par tous les moyens de Sainte-Marie...
